支出運營管理
美國高校智庫的資金支出比重主要在項目費用上。以胡佛研究所為例，調研和學術費用、物資設備費用占總支出的相當一部分，這方面的支出便是服務項目研究經費，包括增加研究獎金，推出新的研究項目，項目調研、監管和法治費用，擴大獎學金費用，在圖書館和檔案館中的資料使用、引入綜合數字項目，管理胡佛研究所網站等。另外，胡佛研究所和斯坦福大學在財務上有著較大的關聯。胡佛研究所與斯坦福大學的合作主要是通過儲備金的形式，如此保障了兩個機構的研究項目以及在其他方面研究建樹的可能條件。另外，胡佛研究所對於自身認為重要的研究方向，往往採取預先投資的方式，來保障下屬的研究機構長久關注有價值的研究方向。總之，資金決定智庫研究成果的質量，美國高校智庫的費用支出直接說明了美國高校智庫為何能夠對美國的政治、社會，甚至是世界局勢產生重大的影響。
對研究項目的宣傳也是美國高校智庫財務管理中的重要一環，美國高校智庫對此採取了積極有效的手段。學術成果宣傳方面也可以帶來智庫的收入，因而對智庫發展十分重要，在2013—2014年度，胡佛研究所獲得了458000美元的利息、期刊和出版物收入。所以說，智庫通過網絡媒體、期刊、節目訪談等一系列手段能夠為自身做很好的宣傳，同時也為智庫成果的影響力提升以及智庫未來的發展帶來很好的收益。從每年增長的相關資金來看，美國高校智庫對這一點是十分關注的。
智庫財務管理中的另一個重要方面則是利潤分配管理。從各大高校智庫的財務報告中可以看到，美國高校智庫資金支出中，員工福利和工資支出所占比例是相當大的。例如，胡佛研究所實行聯合聘任制，由胡佛研究所和斯坦福大學共同聘任研究人員，研究人員因此可以獲得來自斯坦福大學和胡佛研究所雙方共同支付的工資。科研人員優厚的工資以及福利水平不斷提高是智庫發展的重要保障。即使在年財政增長幅度較小的情況下，智庫項目費用和研究人員的支出還是穩定增長的。
當然，高校智庫開支的另外一個方面是對學生培養的投入，比如普林斯頓大學威爾遜公共與國際事務學院（Woodrow Wilson School of Public and International Affairs, WWS）下的普林斯頓—哈佛中國和世界項目中心（Princeton-Harvard China and the World Program, CWP）就投入大量資金用於研究生的培養，該機構對研究生申請獎學金進行審查，這些申請項目是和中國與世界項目或者國際安全主題有關，如果通過的話，研究生能夠獲得大致2500美元/年的資助，通過這種資金資助的方式可激發研究生對中國和世界項目的研究熱情。
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