這個人事變化，雖然予人“要來的總歸要來”的感覺，但因為太突然，事前沒有任何蛛絲馬跡或試探風聲，因而震動了台灣政壇。其背景如何，耐人尋味。或許，是蔡英文在分享不到政黨輪替“勝利成果”的“獨派”的強大壓力之下，不得不進一步減輕蔡政府的“老藍男”比例；也可能是“老藍男”的行事風格以至意識形態與民進黨基本不同，兩者之間都並不能互相適應，林碧炤和楊國強都無法完成蔡英文所託付的任務，因而不得不“掛冠歸去”，甚至是“不為五鬥米折腰”。
回想當初，蔡英文在組閣時，對人事抓得很緊，除財政首長是授權林全配備，及涉及意識形態的部會如教育部、文化部由懷有“去中國化”的民進黨人毛遂自薦之外，與鞏固政權相關的職位，尤其是依法按慣例由總統直接掌握的國安系統職位，都是由蔡英文親自物色並作出的決定。而為了踐行“軟對抗北京”策略，亦即一方面繼續拒絕承認“九二共識”及其“兩岸同屬一個中國”的核心內涵，另一方面不挑釁、不刺激北京，而物色了幾位年齡偏大的國民黨人，分別出任外交部長、國防部長和陸委會主委，連本應最能領悟自己思路的總統府秘書長”，也是如此。
而在阿扁的八年任內，一共任用了十二位總統府秘書長”，包括其中三人曾經再任，及有兩人是代理，全部清一色都是民進黨籍。但蔡英文卻找了老國民黨人林碧炤，還將他與國安會秘書長吳釗燮稱為她的“左右膀”，可能是出於如下的幾個原因：
其一、基於在蔡英文奉命研擬“特殊兩國論”時，兩人結下的友好合作關係。實際上，據台聯前主席黃崑輝去年十二月出版的《誠的力量：黃崑輝八十憶往》一書透露，李登輝在一九九八年八月正式成立“強化中華民國主權國家地位研擬小組”，由蔡英文領軍，並召集多位極為年輕的法政學者參與研究，而時任總統府副秘書長”的林碧炤當時即擔任小組的三位顧問之一（另二人是國安會諮詢委員張榮豐、陳必照）。蔡英文在林碧炤等人協助下，形成了“特殊兩國論”的論述，李登輝極為滿意。因而在阿扁當選總統後，向其推薦蔡英文作“陸委會主委人選。而蔡英文的四年任期結束後，為報答李登輝，向阿扁推薦了林碧炤為新任“陸委會主委人選，但阿扁卻挑選了林碧炤在政治大學的同事吳釗燮。蔡英文當選總統後，就以委任林碧炤為權位更高的總統府秘書長”以作補償，而且也是以為兩人將會發揚光大在研擬“特殊兩國論”時培植的合作默契關係。 |
