辛亥革命引爆了第三波武裝抗日
1902年，總督府以誘惑、欺騙、強迫等手段，殘酷殺害武裝抗日首領及同志數千人後，台灣各地開始平靜起來，但實際上各地反日義士攝於日本人的威權，反日情緒處於埋藏期，一旦有導火線，反抗運動就像火山一樣爆發。受中國辛亥革命的影響，從1902年到1915年，台灣各地爆發了多起武裝抗日活動，這也是台灣人武裝抗日的第三期。此時期陸續有13起零星武裝抗日事件。在這些事件中，有11件是1911年中國大陸辛亥革命的影響而發生，特別是其中的4件明確要與大陸的辛亥革命相呼應。儘管這樣，依然有別有用心的台灣研究者硬是將這些事件與所謂的“獨立意識”聯繫起來，借普通民眾對台灣史的不瞭解，來誤導民眾的歷史觀，以達到相關塑造台灣人民的主體意識的目的。他們竟然在維基網站上公然宣稱在“這13起事件中宣稱台灣與大清帝國友好的有4件，稱王稱帝、要自立台灣王朝的有6件，兩者皆可的1件，不明其目標的2件。由此數位可以發現，欲自立台灣獨立國家或政權的比例，超過與大清帝國友好的部分。”⑥維基的觀點體現台灣個別學者完全無視歷史事實。這個時期幾大武裝反抗殖民統治者的起義的歷史史實，足以辯駁台灣某些台獨學者有意篡改歷史的險惡用心。
北埔事件是此時期第一次大的起事。當時正值佐久間總督加緊征討山地，派遣一批批軍隊及警察隊討伐番人。當局擬召北埔管內之隘勇，援助大溪嵌，隘勇們不願意前往，心存怨氣。居住在北埔支廳月眉莊的蔡清琳，素仇恨日本人。他到處宣揚已經與祖國軍隊約定好，祖國大軍將從舊港登陸，先攻佔新竹，漸次擴展到全島，最後光復台灣。隘勇們皆信以為真，表示願意參加。蔡清琳採取同樣的方法，勸誘山地同胞，山地同胞更是表示支持。
林圯埔事件起源於林啟楨事件。劉幹借此事件招集莊民集會，藉神佛指示，宣傳曰：“我前日在國姓爺廟，夢見三聖人對我指點，命我為明朝崇禎帝義子，驅逐日人，救民於水火，故你等須聽我之命令指揮，共成大事，事成之日，得地得管，皆從所欲，如有不聽命令者，余必處之死刑。”⑦1912年3月23日清晨，劉幹指揮同黨，襲擊了距林圯埔約十里的頂林派出所，殺死日本人巡查飯田助一、川島與川及巡查補陳霖仔。⑧
土庫事件是嘉義廳大埤頭莊青年黃朝，平素非常關心祖國的各種事情。辛亥革命成功的消息傳到台灣，給這個年輕人很大的鼓舞，他與忘年交黃老鉗，為祖國革命情懷所感染，相互稱為同志，討論以何種手段獲得同志，認為：祖國革命成功，推翻滿清二百餘年帝業，定中華民國基礎，我亦人也，豈不能驅逐日人，而為台灣國國王乎？林圯埔劉幹只有十餘人，猶能擊殺警察，而使頂林派出所全滅，我若廣集同志，又何愁革命大業不成。⑨
西來庵事件是日本據台時期最後一次武裝反抗事件。主要領導人為（閩）福建人余清芳。余清芳以西來庵廟作為籌畫革命的基地。他對信徒傳播，日本原本只有佔領台灣二十年的運，現在已將要期滿，屆時中國大陸會調派軍隊相助，我們應該裡應外合，迅速將日本人擊退。⑩他還宣傳日本暴政，喚起群眾的民族意識，而且利用扶乩請神諭等方法，讓信徒們相信台灣革命一定成功。總督府認為事態嚴重，派出台南步兵第2聯隊約一千人進行鎮壓。根據當地人盛傳，死難者達3,200餘人。⑪這場屠殺是1895年乙未戰爭以來規模最大者，因此有不同的資料留傳，最多者有謂屠殺30,000餘人。不過根據考證，三千餘人是一個較可信的數字。⑫9月22日余清芳餘部也遭日本軍警逮捕。
從以上事件史實來看，無一不與中國相聯繫，他們或寄希望於祖國的幫助或受辛亥革命成功的鼓舞，他們都有強烈的民族意識，根本沒有今天的“台獨意識”，他們即使有宣稱“獨立”也是希望台灣脫離日本殖民統治，並將其作為回歸中國的前提。
日據台灣後期沒有抗日活動的說法是錯誤的
1937年“七七事變”爆發之時，台灣已經被日本殖民統治了四十二年。儘管如此，總督府馬上於9月10日，根據近衛內閣的“國民精神總動員運動”，通過了國民精神總動員實施綱要及本部規程，在總督府設立本部，組織本部參與會，下設州廳支部、市郡支會、街莊分會，開展國民精神總動員運動。總督府又以禁止報紙漢文欄，廣泛利用大眾傳媒手段，採用廣播通訊、出版報紙雜誌等方式，向台灣民眾灌輸日本“被迫戰爭”的思想，皇民化台灣人民，以圖安定殖民地的民心。但這些都無法阻止台灣人民對祖國大陸的深切關心，除了有些人內渡到大陸，參觀抗戰活動外，台灣島內各種反抗的言論及行動也有很多。大量原始檔案證明，台灣同胞在“七七事變”爆發後，雖身處日本的殖民統治下，仍在台灣各地不斷掀起反抗日本侵略中國、預言日本必敗的反抗言論及行動。
從日本防衛省防衛研究所現藏史料來看，這些文件是根據當時台灣憲兵隊長、總督府警務局長、各州知事及廳長的通報編纂的，由台灣軍方高級長官向日本陸軍最高長官提供的情報資料，例如在1927年9月1日，台灣軍司令部參謀長秦雅尚，報給陸軍次官梅津美治郎的“台軍作第43號”密件：《通過北支事變看本島人的皇民化程度》。
這十八份資料，記錄了從1937年“七七事變”爆發後，從8月中旬開始到1940年6月的三年間，台灣島內民眾大量的充滿祖國情結與民族大義的反抗事件及反日言論。台灣民眾的反抗行為及言行，應令日本殖民統治者極為擔心，認為台灣民眾“還是過信中國方面的實力，由於民族觀念而視中國為祖國，誹謗日本，有過半的民眾希中國的勝利乃至台灣要回歸祖國。”⑬由於資料龐多，本人僅就第一件文件《通過北支事變看本島人的皇民化程度》的文件進行整理研究，通過這份檔案文件可以看出，在這短短一個多月的時間裡，台灣島內就有70多件反抗事件發生。
1、以投書形式出現的反抗事件，計共9件
2、以落書標語形式出現的反抗事件，計有4件
3、以具體行動進行的反抗事件，計有6件
4、以言論行為出現的反抗事件，計有52件
這份資料表明，儘管七七事變爆發時，台灣已經被日本殖民統治了四十二年，但台灣人民心中仍然強烈懷念著清朝時期自由的生活方式，強烈地不滿總督府的各種苛政，憎惡日本殖民統治者；也因無法改變的民族性，視中國為其祖國，並心向祖國，其所表現出來的思想內容大致可歸納為以下幾點：
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