第一，從行政院大陸委員會主委的人事安排來看，透露矮化、弱化與大陸關係：
最初的設計位階是高於部會，主委是由行政院副院長兼任（第一任是由行政院副院長施啟揚兼任），首席副主委是部長級的特任官（第一任是由當時的行政院研考會主委馬英九總統調任），另兩位副主委則係比照簡任14職等的政務副主委（第一任是高孔廉、謝生富二人）。待施啟揚轉任司法院長後，由內政部長黃昆輝調任（馬英九總統等三位留任）。
直至2014年，陸委會主委出缺時，才比照中國大陸由外交系統，亦即由外交部副部長王毅、張志軍等升任國台辦主任的模式，由外交部副部長夏立言升任。
但是，520蔡英文上任後，竟提拔外交部常務次長（事務官）張小月三級跳為陸委會主委。以張小月的資歷、背景觀之，是陸委會有史以來資歷最淺，聲望、輩分最低的主委，是否有意矮化、弱化對大陸之關係，抑或蔡英文想利用國安團隊全盤掌控大陸政策而將張小月當成大陸事務幕僚長，均值得深入觀察。
第二，新政府對海基會董事長之人事任命，迄今懸而未決，其態度引人深思。
第三，林全於520就任後的第一個上班日（5月23日）立即下令撤回對太陽花學運126位違法侵占立法院與行政院被告之告訴，引起多數“國人”之不滿。其實，當時領導與參與“太陽花學運”的首要人物，除了部分是湊熱鬧的大學生外，大都是民進黨與時代力量的重要成員與支持者，許多更具有台獨傾向者。
謝介銘表示，林全下令撤告有三個後遺症：其一是以政治否定司法；其二是縱容非法、鼓勵非法；其三是討好台獨支持者。這將在台灣司法史上留下一頁惡劣的紀錄，也嚴重影響維護治安的警察未來執法上的困惑。
第四，原來深藍的國防部長馮世寬，在6月3日面對立法委員質詢時，從一開始的“我不支持台獨，到後來變成“收回這句話”，甚至在民進黨立委管碧玲的引導下，明確表示，台獨如公投通過，他會順從民意予以支持。
第五，520蔡英文就職後，連續接待大批來參加就職大典的外賓時，除依國際慣例使用中文談話外，其間經常夾帶英文，且在用英文介紹中華民國時言必稱：“台灣政府”，不無凸顯“台灣主體性”之意涵，其用語背後意義，值得觀察。
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