黃奎博分析，上述情況會給兩岸關係產生幾方面的深刻影響。第一個是兩岸的法理定位，會從很久以前的雙方同屬“一中”逐漸演變成雙方是各自不同的國家。這個趨勢其實從李登輝的後期開始逐漸成長，經過民進黨兩次執政到達一定的高峰。現在賴清德的做法，還很明顯地是要推動所謂的“台灣主體性”，這不只是政治和文化分隔，還是民族分隔，也就是“台灣主體性”已經跟所謂的“台灣民族主義”混合在一起，逐漸的就會變成“台灣民族主義”對撞“中國民族主義”或者“中華民族主義”，兩岸的衝突就會從過去所謂的“政治制度優劣”競爭，逐漸演變成“族群的衝突”。與“政治衝突”能夠靠政治協商或妥協得到一定控制甚至解決不同，“族群的衝突”因為“你我”區分明顯，一旦發生衝突後果會相對嚴重，不是一時半刻，或者通過政治的溝通協商就可以有效處理。也就是說在這樣的情況之下，台灣可能會和中國大陸發生“民族主義對撞”，這對兩岸關係的發展可以說是非常不利。
第二，賴清德的兩岸政策很明顯會延續蔡英文總統時期依靠美國的做法，甚至是“一面倒”，這會讓他更加順從美國，然後在兩岸關係上採取若即若離的態度，這樣也比較符合他想要形塑“台灣民族主義”的企圖。
最後，賴清德會希望借著兩岸的功能性合作，包括ECFA，讓台灣可以從中獲得一定利益。但是在政治上面賴清德將“寸步不讓”並朝自己堅持的方向移動。
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