該書於2016年6月開始編撰，由十幾位來自全國台聯、福建省台聯、福建省委黨校、福建省檔案館、廈門大學、福建師範大學、台灣抗日志士親屬協進會、台灣海洋大學、台灣佛光大學等海峽兩岸的專家學者共同合作編撰。
這些學者中既有海峽兩岸學界聲望卓著的專家，也有抗日戰爭研究領域學有專長的學科帶頭人、學術骨幹，更有風華正茂、銳意進取的後起之秀。
汪毅夫表示，閩台兩地具有地緣、血緣、文緣、法緣、商緣等深厚的文化關係，共同構成了一個不可分割的整體。正是在這樣的整體內，閩台兩地民眾發生過許許多多共同反抗外國侵略的鬥爭，對保衛台灣、維護中華民族根本利益作出了巨大貢獻。在中國人民長達14年艱苦卓絕的抗日戰爭中，閩台兩地的區域性抗日鬥爭，共同構成了閩台抗戰的歷史過程。
汪毅夫提到，在抗日戰爭史研究領域，很少有人將閩台抗戰史作為一個整體性的區域史進行研究，而在閩台關係的探討中也很少有人對閩台民眾合作抗戰的歷史進行深入的分析。因此，這部由兩岸學者共同編撰的《閩台抗戰史》，一方面彌補了在抗日戰爭研究領域閩台區域抗戰史研究的不足，對抗日戰爭的區域歷史研究提供了一個有價值的範本，具有重要的學術意義；另一方面又在一定程度上彌補了當代閩台關係研究的不足，對增強兩岸民眾關於抗戰歷史的共同認知，充分體現兩岸民眾休戚與共、血濃於水的同胞親情和中華民族勇於反抗侵略的民族精神，具有重要的現實意義。
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