從技術角度來看，中段反導的優勢有以下幾個：
首先，中段反導可多次攔截以提高攔截成功率。彈道導彈在助推段後即進入飛行中段，而要攔截助推段是要將攔截和探測系統前置到導彈發射區域。而作為攔截系統最早可以攔截的時機便是導彈的中段飛行階段。這樣做也可以為後續的攔截預留充足的準備時間。以美國目前的陸基中段反導為例，即使在一次攔截失敗後，還能有第二次攔截的機會，若再次失敗，則可以將攔截任務轉給末段反導系統（主要是“薩德”和“愛國者”導彈系統）。
其次，中段攔截的高度大，覆蓋範圍廣。這是因為中段攔截是從導彈源頭實施攔截，而在導彈射角一定的情況下，此時射向變換距離較小。如果進入末段，在相同射向角的情況下，射向變換距離較大，彈頭飛行範圍也較大，需要多個系統實施攔截。例如，美國陸基中段反導系統的攔截彈（GBI）的防禦距離達到數千千米，所以美國一開始計畫部署的國家導彈防禦計畫（NMD）只計畫了兩個西海岸的反導攔截基地，就實現了對美國本土的導彈防禦。
最後，中段攔截可減少附帶傷害。因為中段攔截多發生在外太空，碰撞後的碎片殘骸會在墜入大氣層的過程中燃燒殆盡。這一點對來襲導彈帶有生化彈頭尤其有效。
不過中段反導系統牽扯的子系統眾多，各個技術難點十分突出。以攔截彈的飛行速度為例，美國海基中段的“標準”3 Block1導彈關機速度為2.5-3.3千米/秒，攔截高度160千米。改進後的“標準”3 Block2關機速度達到5-5.5千米/秒，攔截高度達到500千米。部署在美國本土的GBI攔截彈的關機速度超過7千米/秒。而作為高空攔截系統的THAAD導彈關機熟讀祗有2.8千米/秒，攔截高度就下降到了150千米，不過這樣的攔截高度已經可以勝任攔截射程在2000千米的彈道導彈。
而攔截彈的彈頭由於採用了動能碰撞技術（KKV），也就是攔截彈的彈頭速度非常高，利用其本身的質量和高速度撞擊摧毀目標。因此對攔截彈頭在制導、姿態控制、彈頭載荷等各方面提出了更高的要求。
更為重要的是中段攔截最難的是對來襲導彈釋放的誘餌彈頭的識別問題。中段飛行處於太空中，由於失去了大氣壓強，可以在將其釋放後迅速膨脹為氣球。而這些氣球表面塗有金屬錫箔塗層，可以反射雷達信號。並且可以在內部加裝加熱裝置，模擬成真彈頭的熱紅外特徵。而要識別這樣的誘餌是需要發展大功率X波段雷達，因為祗有X波段是可以穿過大部分的氣球薄壁，從而識別出真彈頭。
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