究竟是人為失誤還是機體缺陷？圍繞沒有先例的事故調查，曾擔任過日本防相的人士敲響警鐘稱，“如果存在缺陷，將把主導開發的美國卷進來，成為美日的問題”。然而，日本外務省官員稱“首先是防衛省負責，不是外務省出頭的時候”，欲防止火星擴散牽扯到外交問題。
預計一架價格約116億日元(約合人民幣7億元)的F-35A，是日本首相安倍晉三2018年11月末在阿根廷舉行的美日首腦會談上承諾大量採購的戰機。為安撫強烈要求削減對日貿易逆差的特朗普，安倍打出了這一王牌，因此被視為“首相項目”(外交消息人士語)。
如果日本的採購計畫陷入停滯狀態，也可能使特朗普生疑。美日兩國政府計畫月內在美國首都華盛頓舉行外長防長參加的安全保障磋商委員會(2+2)會議以及首腦會談，外務省官員流露出“希望極力避免過度反應”的想法。
存在缺陷
另一方面，鑒於此次墜機事故，美國國防部表示將“關注”今後查明原因的進展(國防部官員語)。
據美軍透露，目前在引進該機型的日本等國，共有390多架F-35進行運用，預計到年底將達到近500架。已決定採用的國家超過10個，美國政府計畫進一步推銷到希臘及波蘭等國。
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