我軍原來實行的軍委總部體制，對推動我軍建設發展、保證各項工作任務完成發揮了十分重要的作用。同時，隨著形勢和任務發展，這種體制存在的問題也日益凸顯，特別是四總部權力過於集中，事實上形成了一個獨立領導層級，代行了軍委許多職能，不利於軍委集中統一領導。
這次改革，軍委機關由總部制調整為多部門制，由領導機關、決策機關轉變為參謀機關、執行機關、服務機關，告別“領導範”，當起“辦事員”，對上直接為習主席和軍委服務，對下指導協調部隊貫徹落實黨中央、中央軍委和習主席決策指示。
從職能泛化到專注戰略謀劃和宏觀管理。過去，總部機關集管理、建設、指揮於一體，事無巨細一把抓，管了許多不該管的、管不好的，職能泛化、條塊分割、政出多門、相互掣肘、戰略功能不強的問題比較突出。這次軍委機關改革——
從職能定位入手，優化職能配置和機構設置，強化戰略管理職能，把管全局、管政策、管規劃等職能單列出來，部分具體事權下放軍種；強化戰略指揮職能，剝離原總部大部分建設管理職能，突出戰略指揮和軍事鬥爭准備牽引指導；強化法紀監督職能，把紀檢、政法、審計部門獨立出來，增強監督部門權威性；整合相近職能，集中配置信息化、裝備發展、人力資源管理等領域職能。
這樣調整，聚焦中心、抓大放小，軍委機關主抓全局問題、宏觀問題、頂層問題，重點管政策、定規劃、拿標准、作評估、抓監督，不再大包大攬、一竿子捅到底。
從臃腫龐雜到精簡高效。20世紀80年代，鄧小平曾尖銳指出：“中央龐大的機關，不要說指揮打仗，跑反都跑不贏。”長期以來，總部機關龐大臃腫、機構重叠、層級太多、直屬單位龐雜的問題一直沒有得到很好解決。這次改革，看上去部門多了，但總的是層級減了、等級降了、人員少了。這個“多”，是符合現代軍隊專業分工和職能配置的多，是符合系統論要求的多，是符合權力運行規律的多。
軍委機關各部門根據職能定位和地位作用確定等級，實行差異化設置，不搞平衡、不搞一刀切；總體實行“部—局—處”三級體制，壓縮精簡機關和直屬單位編制員額，在精兵簡政、解決“頭重尾巴長”問題上邁了一大步，為全軍調整改革樹了好樣子。
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