但“機關算盡太聰明”，吳敦義的民調始終都只能是在個位數中徘徊，迫使他不得不放棄參選總統，而改為轉戰立委，打算將自己列名“不分區立委第一名，倘國民黨議席過半，立法院長就篤定是自己的。吳敦義曾任立委，對議事程序嫻熟，要當立法院長算是能夠適任。而且在打響“黨主席保衛戰”，刪除黨章中總統兼任黨主席的條款後，由黨主席兼任立法院長，雖然“吃相難看”，但畢竟可以使得立法院黨團能夠貫徹黨的意志。
但在國民黨和民進黨的公職參選史中，都未曾有過黨主席將自己列為“不分區立委名單的。如果此說屬實，那就是“小公雞破啼兒－－第一次”了。這當然遭到國民黨選戰操盤部門的抵制和反對，其中就以李哲華的態度最堅決，認為倘將吳敦義列入“不分區立委名單，外界觀感不好，將會連帶影響總統和立委大選的選情。這就“得罪”了吳敦義，非要“拔”掉他不可了。實際上，組發會主委在國民黨六大部門中，重要性僅次於政策會執行長一職，但更重要的是掌管“不分區立委提名辦法的擬制權及名單建議權。吳敦義不搬開這塊“絆腳石”，就根本不可能被列入“不分區立委參選人名單，更遑論是第一名。
實際上，立委分為“區域立委與“全國不分區及僑選立委、“原住民立委三種。其中“區域立委和“原住民立委都是一人一票的直接選舉，必須實際投入地方選戰，選戰打得很辛苦，而且未必保證能贏。而“不分區立委候選人則是不用直接參選，而是憑藉自己所在政黨的得票率而決定是否當選，因而又稱“政黨票立委。在過去實行“聯立制”時，立委選舉只有一張選票，以某政黨所有候選人的總得票率，來計算該黨的“不分區立委分配名額及政黨選舉補助金。改為類似“並立制”的“單一選區兩票制”後，政黨票的得票率不再跟隨“區域立委，而是由另一張“政黨票”的得票率，來計算該政黨所獲分配“不分區立委名額及政黨選舉補助金的數額，因而也叫“政黨票”。
“不分區立委制度的設計原意，在於“區域立委必須投入地方選戰，因此在競選主軸與選民服務上，會偏向地方利益為主.，所以需要有能夠代表政黨，從整體大方向考量的立委.”，不投入地方選戰，以便於跟地方勢力及利益脫鉤。.而且，也是針對“區域立委的專業知識尤其是立法技能偏弱，甚至有黑社會角頭靠賄選混進立法院，導致立法品質欠佳，因而就以“不分區立委來補強之。實際上，各政黨提名的“不分區立委參選人，大多不但是清流人士，而且更是各方面專業的專家。這些人具有專業而不擅長選舉，也有因為是弱勢階層需要保障等等因素，而設計出“不分區立委的制度。 |
