“兩居室”的結構使飛船更靈活，可重複利用的部分也更高。返回艙則採用“墻壁+保溫層”的雙層殼結構，“墻壁”圍起來的是航天員的“駕駛室”，具有容積大、密封性好、艙內視野遮擋少等特點。
飛船只安裝環控生保、人機交互等直接關係到航天員生命安全和飛船操控的相關設備，為“駕駛室”騰出了大量空間，也最大限度地避免了大量設備和航天員共處一室的安全隱患。
設備不占空間，人在裡面也就有了更多活動空間。飛船的“駕駛室”比神舟飛船大了1倍，可分為工作區、娛樂區、餐飲區以及衛生區，為航天員提供了更舒適的乘坐環境。另外這裡還將配置生活娛樂大屏，讓航天員太空旅行變得更加豐富多彩，通過穿戴式顯示儀表，航天員還可以時刻了解飛船的健康狀況。
——更智能自主。舒適安全的座駕也必將伴隨更智能的駕駛功能，與以往行駛路線調整需要飛船和地面測控配合完成不同，飛船的GNC系統可以獨立控制飛船飛行，進一步提高了自主運行能力、在軌生存能力和應用潛力，同時降低了維護運營成本。
試驗船入軌後，“飛船大腦”——GNC系統自主確定行駛路線並進行導航，還能實時掌握飛船當前的位置和速度。簡單來說，“飛船大腦”不僅能知道飛船現在處在什麼位置，而且還知道將要去哪裡，走哪條路能更快到達目的地。有了這些技能，飛船的GNC系統便可以不依賴地面，獨立控制飛船飛行了。
飛船還能自己給自己“看病”。在飛行過程中它實時關注著自己的健康，一旦出現問題，通過系統智能的算法能自己給自己“診斷”。
此外，飛船還採用了固定式智能交互、便攜式人機交互等先進技術，提供智能、友好的人機交互環境。基於虛擬仿真技術（VR）開展艙內空間視覺環境設計以及個人衛生、就餐、工作和存儲等設計，按照智能家居理念開展照明、娛樂、通信和通風等智能控制設計，為航天員提供界面友好、舒適便捷的人居環境。
——更高性價比。隨著我國航天事業的發展，新一代載人飛船將面臨頻繁的天地往返運輸任務，這就需要研發更經濟、更高效的交通工具。新一代載人飛船便計畫通過適應多任務來降低研製成本，通過可重複使用來降低使用成本。
為了實現多功能使用，飛船採用“搭積木”式的模塊化設計，不同任務通過相同的返回艙和不同的服務艙就可完成。換言之，航天員駕駛飛船不僅可以去距離地球近400公里的空間站做客，同時在返回艙不變的基礎上，換上“新鎧甲”和動力更強勁的服務艙，就可以到月球甚至更遠的深空轉一圈。
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